В Україні циркулює п’ять різновидів вірусу SARS-CoV-2 – ЦГЗ

Про це повідомили в Центрі громадського здоров’я України, передає "Еспресо.Захід".

За підсумками досліджень 50 зразків, узятих у пацієнтів з 9 регіонів України (Дніпропетровської, Донецької, Закарпатської, Івано-Франківської, Львівської, Харківської, Хмельницької, Чернівецької областей та м. Київ), з’ясували, що віруси, які циркулюють на території України належать до глобальної генетичної лінії B, що походить із Китаю. Як і кожна інша лінія, вона має різновиди. Зокрема, в Україні визначено такі генетичні варіанти: В1; В1.1; В1.1.1; В1.5 та В2.

•          В1 – віруси цієї групи належать до найчисельнішої групи вірусів, які циркулюють на території Європи та походять з Італії.

•          В1.1 – віруси генетичної лінії В1, які відрізняються трьома нуклеотидними замінами (SNPs 28881GA, 28882GA, 28883GC).

•          В1.1.1 – циркуляцію цих вірусів виявлено одночасно на території країн ЄС і Великої Британії.

•          В1.5 – віруси цієї групи належать до найчисельнішої групи вірусів, які циркулюють на території Європи та походять з Іспанії.

•          В2 – віруси цієї групи циркулюють у понад 57 країнах світу на 6 континентах.

Як пояснили в ЦГЗ, вчені можуть зафіксувати мутації вірусу за допомогою генетичного аналізу коронавірусу – секвенування геному. Процес дослідження складний, тривалий і дорогий. Щоб зафіксувати мутацію, треба дослідити вибірку зразків – кожен зразок окремо. Геном вірусу розрізають на дуже дрібні частинки, а ці частинки завдяки реагентам та спеціальному обладнанню – секвенатору – вивчають і фіксують зміни у геномі вірусу.

Таке дослідження (секвенування) потрібне, щоб виявити, які штами й субтипи циркулюють на тій чи іншій географічній території, як саме поширюється вірус, чи відбулися мутації в його геномі, визначити, з якої країни походить збудник.

Згадані зразки з 9 регіонів України вірусологічна референс-лабораторія Центру громадського здоров’я України, яка входить до світової лабораторної мережі епіднагляду з питань діагностики SARS-CoV-2, надіслала Всесоюзній організації охорони здоров’я для подальшого підтвердження та секвенування. Наразі ЦГЗ має результати дослідження 50 зразків від референс-лабораторії, яка функціонує на базі Public Health England Colindale у Лондоні.

Результати цієї роботи публікують у відкритих базах даних, зокрема GISAID (глобальна наукова ініціатива, яка забезпечує відкритий доступ до геномних даних вірусів грипу і SARS-CoV-2). Така глобальна співпраця дає змогу вченим відстежувати поширення, еволюцію вірусу та надавати оперативні рекомендації щодо протиепідемічних заходів залежно від циркулюючих штамів.

У рамках глобальної мережі лабораторій ВООЗ засновано спеціальну робочу групу з вивчення еволюції вірусу SARS-CoV-2, яка оперативно виявляє його нові мутації та оцінює їхній можливий вплив на сам вірус, а також на ефективність засобів діагностики, лікарських препаратів і вакцин.

У ЦГЗ додали, що з січня 2021 року їхня референс-лабораторія щомісяця надсилатиме вибірку зразків матеріалів для подальшого їх дослідження. Окрім цього, 2021 року Центр планує закупити секвенатор і необхідні реагенти й розпочати дослідження геному вірусу на базі власної референс-лабораторії.

Окрім того, нині секвенування в Україні самостійно здійснює група молодих учених. Вони досліджують 200 зразків від громадян, що були інфіковані SARS-CoV-2 протягом червня – грудня. Дослідження має закінчитися у січні 2021 року. Результати вивчення цих зразків репрезентують Центру громадського здоров’я, а також передані до світової бази даних GISAID, де вони стануть доступні для міжнародної наукової спільноти.

Стежте за найважливішими новинами України та світу разом з "Еспресо.Захід"! Підписуйтесь на наш Telegram-канал